La certification est avant tout un outil qui a pour objectif de sécuriser le client quant à l'intégrité d'une appellation. La certification est garante de la qualité du produit, de sa provenance et de sa conception. Elle suit un cahier des charges définit au préalable par l'organisme de certification.
La certification biologique assure au consommateur la non-présence de quelconque éléments synthétiques ou artificiels. La certification bio certifie que l'ensemble du processus de production est réalisé dans le respect de l'environnement, des principes écologiques et de la bonne gestion des ressources naturelles. Dans le cadre des produits de grande distribution, la société productrice de produits labellisés est soumise au contrôle d'une commission de contrôle, qui garantie la validité du produit en accord avec le cahier des charges définit par l'organisme de label.
Cela peut expliquer la différence de prix entre un produit "classique" et son homonyme bio. La certification, le respect du cahier des charges ou encore la traçabilité du produit de la terre à l'assiette ont un coût pour le producteur et le distributeur qui peut se répercuter sur le prix final. Ajoutons qu'aujourd'hui les prix des produits bio sont de plus en plus proche des prix pratiqués par la production classique avec le développement de la filière bio.
La certification bio en France se fait sous l'égide de la mention Agriculture Biologique (label AB). Toutefois, le label bio européen va devenir obligatoire dans l'ensemble de l'Union dès juillet 2010. Créé en 2000, il restait jusqu'alors facultatif pour le producteur et devra désormais figurer sur les emballages de tous les produits certifiés bio en Europe.
Cette certification est régulièrement mise à jour. Pour l'année 2009 le règlement CE 834/2007 remplacera le règlement CEE 2092/91. Ce nouveau règlement est complété par le règlement CE 976/2008 reportant au 1er juillet 2010 la date d'application relative aux nouvelles indications obligatoires pour les produits bio.
Au niveau mondial, le dispositif qui régit l'agriculture biologique est le codex alimentarius.
Les principales certifications écologiques sont :